建議委托律師起草股權轉讓協議，履行公司法定程序，辦理股東變更手續。

根據《中華人民共和國公司法》第三章、《中華人民共和國公司登記管理條例》第三十五條規定，有限公司辦理股權變更需要提交以下材料：

（一）法定代表人簽署的《公司變更登記申請書》（公司加蓋公章）；

（二）公司簽署《公司股東（發起人）出資情況表》（公司加蓋公章）；

（三）公司簽署的《指定代表或者共同委托代理人的證明》（公司加蓋公章）及指定代表或委托代理人的身份證復印件（本人簽字）；應標明具體委托事項、被委托人的權限、委托期限。

（四）有限責任公司提交股東會決議（由全體股東簽署，股東為自然人的由本人簽字；自然人以外的股東加蓋公章）；有限責任公司未就股東轉讓股權召開股東會的或者股東會決議未能由全體股東簽署的，應當提交轉讓股權的股東就股權轉讓事項發給其他股東的書面通知、其他股東的答復意見，其他股東未答復的，須提交擬轉讓股東的說明。

（五）股權轉讓協議或者股權交割證明（由轉讓雙方簽署，股東或發起人為自然人的由本人簽字；自然人以外的股東或發起人加蓋公章）；

（六）新股東的主體資格證明或自然人身份證明；　　企業法人提交營業執照正副本復印件；事業法人提交事業法人登記證書復印件；社團法人提交社團法人登記證復印件；民辦非企業單位提交民辦非企業單位證書復印件；自然人提交身份證復印件。

（七）公司章程修正案（公司法定代表人簽署）；

（八）法律、行政法規和國務院決定規定變更股東必須報經批準的，提交有關的批準文件或者許可證書復印件；

（九）公司營業執照正副本。

人民法院依法裁定劃轉股權的，應當提交人民法院的裁定書，無須提交第四、五項材料。

公司變更股東，涉及其他登記事項變更的，應當同時申請變更登記，按相應的提交材料規范提交相應的材料。

股權轉讓的法定程序

根據《公司法》、《中外合資企業法》、《公司登記管理條例》等相關法律規定，股東轉讓股權一般應按照以下程序辦理。

(1)、欲轉讓股權的股東向其他股東發出轉讓股權的書面通知，這主要是針對向股東以外的人轉讓股權的規定。股東向其他股東轉讓股權無須通知。

(2)、股權轉讓時如涉及國有資產，土地使用權、工業產權等無形資產的，須依法進行資產評估。

(3)、簽訂股權轉讓協議。

(4)、中外合資或者中外合作有限公司股東轉讓股權的，根據《中外合資企業法》和《中外合作企業法》的有關規定，必須向中方股東的上級主管政府部門審批，并報有關政府部門審批同意后辦理轉讓手續。

(5)、收回并注銷原股東的出資證明書，給受讓股權的新股東發出資證明書。

(6)、修改公司章程和股東名冊中有關股東及其出資額的記載。

依照上述程序完成股權轉讓后，公司應依據有關法律規定自轉讓股權之日起30日內向工商行政部門申請辦理股東、章程等事項的變更登記手續。有限公司只有按照上述程序辦理股權轉讓手續，才能保障股權轉讓的完全法律效力。

轉讓股權為國有資產的處理

為專門應對國有資產流失嚴重的現象，國務院頒布了《國有資產評估管理辦法》和《國有資產評估管理辦法實施細則》二部行政法規。根據該法律規定，當國有資產有償轉讓超過百萬元或占全部固定資產原值百分之二十以上時，必須進行資產評估。如未進行評估，相關轉讓行為即違法。在本案件中，A公司與何某簽訂的《股權轉讓協議》因未依法對國有資產進行資產評估，從而違法了法律的強制性規定。根據《合同法》的規定，該協議應當無效。轉讓協議被確認為無效后，當事人應當恢復原狀，何某應將股權返還給A公司，A公司將收取的350萬元轉讓款退還給何某。